国产非转基因大豆未来命运如何，正是振兴中国大豆业最为关键的因素。如果国产大豆产量萎缩，中国仅有的在非转基因大豆上的定价优势也将丧失。国家应当从战略角度出发，制定一些长远规划，加大对大豆产业的引导与扶持。我国大豆产业必须发展规模化种植，依靠科学技术发展大豆产业。政府应该采取措施对大豆产业结构进行调整，从大豆育种、选种到种植，到销售、物流，到下游工业，推进大豆产业一体化程度；鼓励和支持设立大豆产业发展基金，从产业和金融政策等方面引导主产区大豆加工企业的联合。

    国产大豆有着转基因大豆不可比拟的优势。转基因大豆是通过改变基因使得油脂含量人为增高，虽然国产大豆的出油率略低于转基因大豆，但国产大豆的蛋白含量高达40%~42%，而美国转基因大豆在36%~38%之间。国产豆营养价值丰富，非常适合酱油、豆制品等领域的深加工。

    令人欣慰的是，已经有企业洞察到其中的商机，并走出了特色产业之路。广东珠江桥总经理吴惠玲说，他们出品的珠江桥酱油一直坚持只从黑龙江购进种植技术要求更高的有机国产大豆。“相比购买进口大豆，我们的成本要增加200元/吨，但其绿色品牌之路受到消费者的认可。”吴惠玲告诉记者，他们的高端酱油能卖到28元/瓶，而市场上同容量的普通酱油只卖4元/瓶左右。她乐观地表示，有机大豆市场需求肯定会越来越大。

    国产非转基因大豆还从加工大豆蛋白中找到了新的希望。中国大豆协会副会长刘登高对记者说，我国大豆具有非转基因、高蛋白的优势，属于食品级大豆。他告诉记者：“近10年来，我国大豆蛋白加工业发展迅速，出口的大豆蛋白已经占世界食品大豆蛋白50%的市场份额，大豆食品蛋白加工已成为我国食品加工的新兴产业。”据不完全统计，我国专门从事大豆食品蛋白加工的企业已近60家，规模以上的、有影响力的企业约20家，其中12家在山东德州，其中包括山松、禹王、谷神等规模较大的企业，这得益于德州作为国产大豆最大现货交易集散地的优势。

    在2011年度广州油料论坛上，外国专家预言，由于转基因大豆的盛行，中国非转基因大豆、高蛋白大豆将成为稀缺资源。近几年，外国食品企业也看好中国大豆的品质，纷纷来中国建厂，用国产大豆加工大豆蛋白再出口到国外。在与转基因大豆加工企业竞争时，中国大豆应该主打绿色牌，不可打价格战。虽然在价格上要高上一些，但是如果消费者的消费观念发生了转变，国产大豆在油脂上也并非没有出头之日。